Au Moyen Age et jusqu'à la révolution, la commune de Buzet incluait le territoire de l'actuelle commune de Saint-Pierre de Buzet.
L'église de Saint-Pierre de Buzet faisait donc partie de la Seigneurie de Buzet. Maurice Luxembourg mentionne dans son article concernant l'histoire de Buzet-sur-Baïse, l'existence d'un prieuré bénédictin Saint-Pierre dépendant de Saint-Sever dès le 10e siècle : donation de Guillaume Sanche, duc de Gascogne, à l'abbaye landaise en 963 ou 982, donation confirmée par Bernard Guillaume vers 1061.

L'existence de ce prieuré est à rapprocher de l'église actuelle. L'édifice est daté du 12e siècle par son plan, son parti architectural et ses sculptures. Seules les parties supérieures du massif occidental semblent avoir été modifiées peut-être au XIVe siècle : création du clocher-mur et protection de la porte nord par une bretèche.